本季的故事情节围绕着莉娜·卢瑟（凯蒂·麦克格雷斯饰）的复仇计划展开。莱克斯·卢瑟在临终前向她透露了卡拉·丹弗斯（梅莉莎·班诺伊饰）的真实身份，即超级少女。这一揭示引发了莉娜的愤怒和决心，她决定对卡拉展开报复，这将对两位曾经的朋友之间的关系产生巨大的影响。

与此同时，本季还引入了一个新的威胁，名为“利维坦”的神秘外星组织。他们的崛起使纳新诺市陷入了更大的危险之中，需要卡拉和她的超级英雄团队全力以赴来保护这个城市和世界。