电影《风雨百泉》背景设定在抗日战争前夕，是一部充满英雄气概和爱国情怀的作品。影片通过描述主人公常宝与黑龙会杀手之间的斗智斗勇，展现了他为了保卫家园和抵御侵略者，勇敢守护的故事。

故事发生在百泉这个药都，这里有一种剧毒的药材叫做“全虫”，日本军方渴望获取它，以制造秘密武器。为了达到这一目的，黑龙会杀手潜入百泉，企图寻找并窃取全虫。然而，他们的计划被常宝，一位药铺学徒，所识破。

常宝了解到黑龙会的阴谋后，毅然决定阻止他们，保卫家乡。在这个过程中，他与日本人展开了智力和体力的较量，情势非常危急。黑龙会杀手为了达到目的，不惜对全镇的药商进行屠杀，迫使他们交出全虫。

常宝在绝境中挺身而出，单刀赴会，奋勇与黑龙会杀手作战。就在他寡不敌众之际，镇长带领百姓赶到，共同奋战，最终消灭了日本人，并且烧毁了所有的全虫。他们坚决停办药交会，誓言要将日本侵略者清除出中华大地。